Protein–RNA interactions for Protein: P04370

Mbp, Myelin basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MbpP04370 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MbpP04370 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MbpP04370 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MbpP04370 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MbpP04370 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MbpP04370 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MbpP04370 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MbpP04370 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MbpP04370 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MbpP04370 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MbpP04370 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MbpP04370 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MbpP04370 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MbpP04370 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MbpP04370 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MbpP04370 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MbpP04370 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MbpP04370 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MbpP04370 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MbpP04370 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MbpP04370 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MbpP04370 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MbpP04370 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MbpP04370 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MbpP04370 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MbpP04370 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MbpP04370 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MbpP04370 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MbpP04370 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MbpP04370 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MbpP04370 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MbpP04370 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MbpP04370 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MbpP04370 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MbpP04370 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MbpP04370 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MbpP04370 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MbpP04370 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MbpP04370 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MbpP04370 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MbpP04370 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MbpP04370 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MbpP04370 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MbpP04370 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MbpP04370 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MbpP04370 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MbpP04370 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MbpP04370 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MbpP04370 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MbpP04370 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MbpP04370 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MbpP04370 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MbpP04370 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MbpP04370 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MbpP04370 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MbpP04370 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MbpP04370 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MbpP04370 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MbpP04370 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MbpP04370 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MbpP04370 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MbpP04370 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MbpP04370 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MbpP04370 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MbpP04370 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MbpP04370 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MbpP04370 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MbpP04370 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MbpP04370 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MbpP04370 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MbpP04370 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MbpP04370 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MbpP04370 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MbpP04370 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MbpP04370 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MbpP04370 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MbpP04370 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MbpP04370 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MbpP04370 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MbpP04370 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MbpP04370 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MbpP04370 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MbpP04370 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MbpP04370 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MbpP04370 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MbpP04370 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MbpP04370 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MbpP04370 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MbpP04370 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MbpP04370 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MbpP04370 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MbpP04370 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MbpP04370 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MbpP04370 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MbpP04370 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MbpP04370 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MbpP04370 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MbpP04370 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MbpP04370 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MbpP04370 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms