Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AfpP02772 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AfpP02772 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AfpP02772 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AfpP02772 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AfpP02772 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AfpP02772 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AfpP02772 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AfpP02772 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AfpP02772 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AfpP02772 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AfpP02772 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AfpP02772 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AfpP02772 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AfpP02772 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AfpP02772 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AfpP02772 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AfpP02772 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AfpP02772 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AfpP02772 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AfpP02772 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AfpP02772 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AfpP02772 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AfpP02772 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AfpP02772 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AfpP02772 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AfpP02772 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AfpP02772 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AfpP02772 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AfpP02772 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AfpP02772 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AfpP02772 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AfpP02772 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AfpP02772 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AfpP02772 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AfpP02772 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AfpP02772 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AfpP02772 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AfpP02772 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AfpP02772 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AfpP02772 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AfpP02772 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AfpP02772 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
AfpP02772 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AfpP02772 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AfpP02772 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AfpP02772 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AfpP02772 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AfpP02772 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AfpP02772 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AfpP02772 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
AfpP02772 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AfpP02772 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AfpP02772 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AfpP02772 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AfpP02772 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AfpP02772 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AfpP02772 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AfpP02772 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AfpP02772 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AfpP02772 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
AfpP02772 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AfpP02772 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AfpP02772 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AfpP02772 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AfpP02772 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AfpP02772 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AfpP02772 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AfpP02772 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AfpP02772 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AfpP02772 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AfpP02772 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AfpP02772 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AfpP02772 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AfpP02772 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AfpP02772 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AfpP02772 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AfpP02772 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AfpP02772 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AfpP02772 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AfpP02772 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AfpP02772 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AfpP02772 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AfpP02772 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AfpP02772 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AfpP02772 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AfpP02772 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AfpP02772 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AfpP02772 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AfpP02772 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AfpP02772 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AfpP02772 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AfpP02772 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AfpP02772 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AfpP02772 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AfpP02772 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AfpP02772 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AfpP02772 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AfpP02772 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AfpP02772 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms