Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tcn2O88968 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcn2O88968 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcn2O88968 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcn2O88968 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcn2O88968 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcn2O88968 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcn2O88968 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcn2O88968 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcn2O88968 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcn2O88968 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcn2O88968 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcn2O88968 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcn2O88968 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcn2O88968 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcn2O88968 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcn2O88968 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcn2O88968 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcn2O88968 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcn2O88968 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcn2O88968 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcn2O88968 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcn2O88968 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcn2O88968 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcn2O88968 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcn2O88968 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcn2O88968 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcn2O88968 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcn2O88968 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcn2O88968 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcn2O88968 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcn2O88968 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcn2O88968 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcn2O88968 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcn2O88968 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcn2O88968 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcn2O88968 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcn2O88968 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcn2O88968 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcn2O88968 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcn2O88968 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcn2O88968 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcn2O88968 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcn2O88968 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcn2O88968 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcn2O88968 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcn2O88968 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcn2O88968 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcn2O88968 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcn2O88968 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcn2O88968 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcn2O88968 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcn2O88968 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcn2O88968 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcn2O88968 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcn2O88968 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcn2O88968 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcn2O88968 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcn2O88968 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcn2O88968 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcn2O88968 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcn2O88968 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcn2O88968 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcn2O88968 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcn2O88968 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcn2O88968 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcn2O88968 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcn2O88968 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcn2O88968 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcn2O88968 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcn2O88968 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcn2O88968 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcn2O88968 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcn2O88968 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcn2O88968 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcn2O88968 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcn2O88968 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcn2O88968 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcn2O88968 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcn2O88968 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcn2O88968 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcn2O88968 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcn2O88968 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcn2O88968 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcn2O88968 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcn2O88968 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcn2O88968 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcn2O88968 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcn2O88968 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcn2O88968 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcn2O88968 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcn2O88968 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcn2O88968 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcn2O88968 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcn2O88968 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcn2O88968 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcn2O88968 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcn2O88968 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcn2O88968 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcn2O88968 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms