Protein–RNA interactions for Protein: O88909

Slc22a8, Solute carrier family 22 member 8, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a8O88909 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc22a8O88909 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc22a8O88909 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc22a8O88909 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc22a8O88909 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc22a8O88909 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc22a8O88909 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc22a8O88909 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc22a8O88909 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc22a8O88909 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc22a8O88909 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc22a8O88909 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc22a8O88909 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc22a8O88909 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc22a8O88909 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc22a8O88909 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc22a8O88909 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc22a8O88909 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc22a8O88909 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc22a8O88909 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc22a8O88909 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc22a8O88909 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc22a8O88909 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc22a8O88909 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc22a8O88909 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc22a8O88909 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc22a8O88909 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc22a8O88909 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc22a8O88909 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc22a8O88909 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc22a8O88909 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc22a8O88909 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc22a8O88909 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc22a8O88909 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc22a8O88909 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc22a8O88909 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc22a8O88909 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc22a8O88909 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc22a8O88909 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc22a8O88909 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc22a8O88909 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc22a8O88909 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a8O88909 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a8O88909 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a8O88909 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc22a8O88909 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc22a8O88909 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc22a8O88909 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc22a8O88909 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc22a8O88909 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc22a8O88909 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc22a8O88909 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc22a8O88909 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc22a8O88909 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc22a8O88909 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc22a8O88909 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc22a8O88909 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc22a8O88909 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc22a8O88909 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc22a8O88909 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc22a8O88909 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc22a8O88909 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc22a8O88909 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc22a8O88909 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc22a8O88909 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc22a8O88909 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc22a8O88909 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc22a8O88909 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc22a8O88909 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc22a8O88909 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc22a8O88909 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc22a8O88909 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms