Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops4O88544 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cops4O88544 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cops4O88544 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cops4O88544 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cops4O88544 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cops4O88544 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cops4O88544 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cops4O88544 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops4O88544 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops4O88544 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops4O88544 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops4O88544 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops4O88544 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops4O88544 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops4O88544 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cops4O88544 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cops4O88544 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cops4O88544 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cops4O88544 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cops4O88544 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops4O88544 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops4O88544 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops4O88544 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops4O88544 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops4O88544 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops4O88544 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops4O88544 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops4O88544 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops4O88544 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops4O88544 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cops4O88544 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops4O88544 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops4O88544 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops4O88544 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops4O88544 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops4O88544 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops4O88544 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops4O88544 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops4O88544 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops4O88544 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops4O88544 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops4O88544 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops4O88544 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops4O88544 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops4O88544 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops4O88544 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops4O88544 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops4O88544 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.8 ms