Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt3aO88508 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnmt3aO88508 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnmt3aO88508 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnmt3aO88508 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt3aO88508 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt3aO88508 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt3aO88508 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt3aO88508 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt3aO88508 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnmt3aO88508 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnmt3aO88508 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt3aO88508 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt3aO88508 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt3aO88508 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt3aO88508 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt3aO88508 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnmt3aO88508 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt3aO88508 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt3aO88508 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt3aO88508 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt3aO88508 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnmt3aO88508 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt3aO88508 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt3aO88508 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt3aO88508 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt3aO88508 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt3aO88508 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt3aO88508 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt3aO88508 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt3aO88508 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnmt3aO88508 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt3aO88508 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnmt3aO88508 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnmt3aO88508 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt3aO88508 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt3aO88508 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt3aO88508 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt3aO88508 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnmt3aO88508 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnmt3aO88508 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnmt3aO88508 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dnmt3aO88508 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt3aO88508 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt3aO88508 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt3aO88508 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnmt3aO88508 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt3aO88508 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnmt3aO88508 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnmt3aO88508 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnmt3aO88508 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt3aO88508 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt3aO88508 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnmt3aO88508 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt3aO88508 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt3aO88508 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt3aO88508 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt3aO88508 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt3aO88508 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt3aO88508 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt3aO88508 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt3aO88508 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt3aO88508 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt3aO88508 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt3aO88508 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnmt3aO88508 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnmt3aO88508 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnmt3aO88508 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnmt3aO88508 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnmt3aO88508 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnmt3aO88508 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dnmt3aO88508 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dnmt3aO88508 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dnmt3aO88508 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnmt3aO88508 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnmt3aO88508 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt3aO88508 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt3aO88508 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt3aO88508 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt3aO88508 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnmt3aO88508 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnmt3aO88508 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt3aO88508 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt3aO88508 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt3aO88508 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnmt3aO88508 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnmt3aO88508 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnmt3aO88508 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnmt3aO88508 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnmt3aO88508 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnmt3aO88508 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnmt3aO88508 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnmt3aO88508 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnmt3aO88508 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnmt3aO88508 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnmt3aO88508 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnmt3aO88508 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnmt3aO88508 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnmt3aO88508 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnmt3aO88508 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms