Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CntfrO88507 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CntfrO88507 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CntfrO88507 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CntfrO88507 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CntfrO88507 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CntfrO88507 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CntfrO88507 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CntfrO88507 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CntfrO88507 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CntfrO88507 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CntfrO88507 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CntfrO88507 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CntfrO88507 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CntfrO88507 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CntfrO88507 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CntfrO88507 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CntfrO88507 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CntfrO88507 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CntfrO88507 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CntfrO88507 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CntfrO88507 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CntfrO88507 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CntfrO88507 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CntfrO88507 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CntfrO88507 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CntfrO88507 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CntfrO88507 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CntfrO88507 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CntfrO88507 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CntfrO88507 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CntfrO88507 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CntfrO88507 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CntfrO88507 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CntfrO88507 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CntfrO88507 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CntfrO88507 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CntfrO88507 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CntfrO88507 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CntfrO88507 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CntfrO88507 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntfrO88507 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntfrO88507 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntfrO88507 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntfrO88507 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CntfrO88507 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CntfrO88507 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CntfrO88507 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CntfrO88507 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CntfrO88507 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CntfrO88507 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CntfrO88507 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CntfrO88507 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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