Protein–RNA interactions for Protein: O88396

Grpel2, GrpE protein homolog 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grpel2O88396 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grpel2O88396 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grpel2O88396 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grpel2O88396 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grpel2O88396 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Grpel2O88396 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grpel2O88396 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grpel2O88396 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grpel2O88396 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grpel2O88396 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grpel2O88396 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grpel2O88396 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grpel2O88396 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grpel2O88396 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Grpel2O88396 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grpel2O88396 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grpel2O88396 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grpel2O88396 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grpel2O88396 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grpel2O88396 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grpel2O88396 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grpel2O88396 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grpel2O88396 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grpel2O88396 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grpel2O88396 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grpel2O88396 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grpel2O88396 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grpel2O88396 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grpel2O88396 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grpel2O88396 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grpel2O88396 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grpel2O88396 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grpel2O88396 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grpel2O88396 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Grpel2O88396 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grpel2O88396 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grpel2O88396 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grpel2O88396 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grpel2O88396 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grpel2O88396 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grpel2O88396 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grpel2O88396 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Grpel2O88396 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Grpel2O88396 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grpel2O88396 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grpel2O88396 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grpel2O88396 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grpel2O88396 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grpel2O88396 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grpel2O88396 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grpel2O88396 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grpel2O88396 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grpel2O88396 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grpel2O88396 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grpel2O88396 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grpel2O88396 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grpel2O88396 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Grpel2O88396 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Grpel2O88396 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grpel2O88396 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grpel2O88396 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms