Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CaskO70589 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CaskO70589 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CaskO70589 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CaskO70589 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CaskO70589 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CaskO70589 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CaskO70589 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CaskO70589 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CaskO70589 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CaskO70589 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CaskO70589 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CaskO70589 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CaskO70589 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CaskO70589 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CaskO70589 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CaskO70589 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CaskO70589 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CaskO70589 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CaskO70589 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CaskO70589 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CaskO70589 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CaskO70589 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CaskO70589 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CaskO70589 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CaskO70589 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CaskO70589 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CaskO70589 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CaskO70589 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CaskO70589 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CaskO70589 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CaskO70589 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CaskO70589 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CaskO70589 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CaskO70589 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CaskO70589 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CaskO70589 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CaskO70589 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CaskO70589 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CaskO70589 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CaskO70589 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CaskO70589 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CaskO70589 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CaskO70589 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CaskO70589 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CaskO70589 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CaskO70589 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CaskO70589 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CaskO70589 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CaskO70589 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CaskO70589 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CaskO70589 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CaskO70589 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CaskO70589 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CaskO70589 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CaskO70589 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CaskO70589 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CaskO70589 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CaskO70589 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CaskO70589 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CaskO70589 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CaskO70589 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CaskO70589 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CaskO70589 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CaskO70589 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CaskO70589 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CaskO70589 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CaskO70589 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CaskO70589 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CaskO70589 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CaskO70589 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CaskO70589 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CaskO70589 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CaskO70589 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CaskO70589 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CaskO70589 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CaskO70589 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CaskO70589 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CaskO70589 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CaskO70589 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CaskO70589 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CaskO70589 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CaskO70589 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CaskO70589 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CaskO70589 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CaskO70589 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CaskO70589 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CaskO70589 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CaskO70589 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CaskO70589 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CaskO70589 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CaskO70589 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CaskO70589 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CaskO70589 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CaskO70589 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CaskO70589 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CaskO70589 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CaskO70589 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CaskO70589 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CaskO70589 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms