Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RngttO55236 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RngttO55236 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RngttO55236 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RngttO55236 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RngttO55236 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RngttO55236 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RngttO55236 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RngttO55236 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RngttO55236 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RngttO55236 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RngttO55236 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RngttO55236 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RngttO55236 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RngttO55236 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RngttO55236 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RngttO55236 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RngttO55236 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RngttO55236 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RngttO55236 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RngttO55236 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RngttO55236 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RngttO55236 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RngttO55236 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RngttO55236 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RngttO55236 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RngttO55236 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RngttO55236 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RngttO55236 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RngttO55236 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RngttO55236 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RngttO55236 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RngttO55236 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RngttO55236 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RngttO55236 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RngttO55236 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RngttO55236 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RngttO55236 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RngttO55236 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RngttO55236 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RngttO55236 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RngttO55236 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RngttO55236 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RngttO55236 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RngttO55236 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RngttO55236 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RngttO55236 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RngttO55236 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RngttO55236 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RngttO55236 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RngttO55236 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RngttO55236 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RngttO55236 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RngttO55236 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RngttO55236 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RngttO55236 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RngttO55236 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RngttO55236 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RngttO55236 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RngttO55236 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RngttO55236 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RngttO55236 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RngttO55236 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RngttO55236 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RngttO55236 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RngttO55236 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RngttO55236 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RngttO55236 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RngttO55236 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RngttO55236 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RngttO55236 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RngttO55236 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RngttO55236 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RngttO55236 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RngttO55236 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RngttO55236 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RngttO55236 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RngttO55236 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RngttO55236 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RngttO55236 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RngttO55236 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RngttO55236 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RngttO55236 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RngttO55236 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RngttO55236 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RngttO55236 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RngttO55236 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RngttO55236 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RngttO55236 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RngttO55236 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RngttO55236 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RngttO55236 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RngttO55236 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RngttO55236 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RngttO55236 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RngttO55236 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RngttO55236 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RngttO55236 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RngttO55236 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RngttO55236 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms