Protein–RNA interactions for Protein: O55192

Slc6a2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a2O55192 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc6a2O55192 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc6a2O55192 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc6a2O55192 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc6a2O55192 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc6a2O55192 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc6a2O55192 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc6a2O55192 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc6a2O55192 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc6a2O55192 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc6a2O55192 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc6a2O55192 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc6a2O55192 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc6a2O55192 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc6a2O55192 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc6a2O55192 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc6a2O55192 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc6a2O55192 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc6a2O55192 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc6a2O55192 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc6a2O55192 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc6a2O55192 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc6a2O55192 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc6a2O55192 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc6a2O55192 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc6a2O55192 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc6a2O55192 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc6a2O55192 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc6a2O55192 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc6a2O55192 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc6a2O55192 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc6a2O55192 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc6a2O55192 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc6a2O55192 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc6a2O55192 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc6a2O55192 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc6a2O55192 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc6a2O55192 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc6a2O55192 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc6a2O55192 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc6a2O55192 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc6a2O55192 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc6a2O55192 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc6a2O55192 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc6a2O55192 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc6a2O55192 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc6a2O55192 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc6a2O55192 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc6a2O55192 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc6a2O55192 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc6a2O55192 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc6a2O55192 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc6a2O55192 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc6a2O55192 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc6a2O55192 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc6a2O55192 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc6a2O55192 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc6a2O55192 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc6a2O55192 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc6a2O55192 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc6a2O55192 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc6a2O55192 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc6a2O55192 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc6a2O55192 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc6a2O55192 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc6a2O55192 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc6a2O55192 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc6a2O55192 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc6a2O55192 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc6a2O55192 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc6a2O55192 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc6a2O55192 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc6a2O55192 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc6a2O55192 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a2O55192 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a2O55192 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a2O55192 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a2O55192 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc6a2O55192 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc6a2O55192 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc6a2O55192 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc6a2O55192 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc6a2O55192 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc6a2O55192 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms