Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pja1O55176 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pja1O55176 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pja1O55176 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pja1O55176 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pja1O55176 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pja1O55176 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pja1O55176 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pja1O55176 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pja1O55176 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pja1O55176 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pja1O55176 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pja1O55176 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pja1O55176 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pja1O55176 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pja1O55176 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pja1O55176 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pja1O55176 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pja1O55176 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pja1O55176 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pja1O55176 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pja1O55176 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pja1O55176 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pja1O55176 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pja1O55176 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pja1O55176 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pja1O55176 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pja1O55176 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pja1O55176 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Pja1O55176 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pja1O55176 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pja1O55176 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pja1O55176 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pja1O55176 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pja1O55176 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pja1O55176 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pja1O55176 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pja1O55176 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pja1O55176 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pja1O55176 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pja1O55176 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pja1O55176 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pja1O55176 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pja1O55176 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pja1O55176 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pja1O55176 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pja1O55176 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pja1O55176 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pja1O55176 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pja1O55176 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pja1O55176 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pja1O55176 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pja1O55176 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pja1O55176 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pja1O55176 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pja1O55176 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pja1O55176 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pja1O55176 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pja1O55176 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pja1O55176 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pja1O55176 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pja1O55176 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pja1O55176 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pja1O55176 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pja1O55176 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pja1O55176 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pja1O55176 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pja1O55176 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pja1O55176 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Pja1O55176 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pja1O55176 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pja1O55176 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pja1O55176 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pja1O55176 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pja1O55176 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pja1O55176 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pja1O55176 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pja1O55176 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pja1O55176 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pja1O55176 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pja1O55176 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pja1O55176 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pja1O55176 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pja1O55176 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pja1O55176 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pja1O55176 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pja1O55176 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pja1O55176 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pja1O55176 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pja1O55176 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pja1O55176 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pja1O55176 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pja1O55176 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pja1O55176 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pja1O55176 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pja1O55176 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pja1O55176 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pja1O55176 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pja1O55176 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pja1O55176 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms