Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn20O55082 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn20O55082 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn20O55082 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn20O55082 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn20O55082 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn20O55082 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn20O55082 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn20O55082 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn20O55082 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn20O55082 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn20O55082 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn20O55082 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn20O55082 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn20O55082 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn20O55082 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn20O55082 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn20O55082 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn20O55082 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn20O55082 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn20O55082 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn20O55082 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn20O55082 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn20O55082 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn20O55082 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn20O55082 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn20O55082 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn20O55082 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn20O55082 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn20O55082 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn20O55082 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn20O55082 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn20O55082 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn20O55082 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn20O55082 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn20O55082 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpn20O55082 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpn20O55082 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn20O55082 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn20O55082 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn20O55082 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn20O55082 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn20O55082 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn20O55082 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn20O55082 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn20O55082 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn20O55082 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn20O55082 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn20O55082 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn20O55082 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn20O55082 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn20O55082 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn20O55082 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn20O55082 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn20O55082 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn20O55082 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn20O55082 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn20O55082 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn20O55082 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn20O55082 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn20O55082 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn20O55082 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn20O55082 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn20O55082 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn20O55082 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn20O55082 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn20O55082 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn20O55082 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn20O55082 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn20O55082 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn20O55082 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn20O55082 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn20O55082 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn20O55082 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn20O55082 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn20O55082 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn20O55082 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn20O55082 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn20O55082 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn20O55082 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn20O55082 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn20O55082 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn20O55082 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn20O55082 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn20O55082 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms