Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cacna1bO55017 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1bO55017 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1bO55017 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1bO55017 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1bO55017 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1bO55017 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1bO55017 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1bO55017 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1bO55017 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1bO55017 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1bO55017 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna1bO55017 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna1bO55017 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1bO55017 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1bO55017 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1bO55017 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1bO55017 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna1bO55017 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna1bO55017 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna1bO55017 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna1bO55017 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1bO55017 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1bO55017 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna1bO55017 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1bO55017 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1bO55017 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna1bO55017 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1bO55017 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1bO55017 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna1bO55017 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1bO55017 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1bO55017 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1bO55017 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna1bO55017 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna1bO55017 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna1bO55017 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1bO55017 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1bO55017 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1bO55017 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna1bO55017 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna1bO55017 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1bO55017 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1bO55017 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacna1bO55017 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna1bO55017 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna1bO55017 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1bO55017 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1bO55017 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cacna1bO55017 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna1bO55017 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1bO55017 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1bO55017 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1bO55017 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1bO55017 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna1bO55017 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna1bO55017 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1bO55017 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1bO55017 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1bO55017 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1bO55017 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1bO55017 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1bO55017 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1bO55017 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1bO55017 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1bO55017 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1bO55017 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1bO55017 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1bO55017 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1bO55017 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1bO55017 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1bO55017 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1bO55017 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1bO55017 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1bO55017 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1bO55017 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1bO55017 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna1bO55017 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna1bO55017 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1bO55017 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1bO55017 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1bO55017 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms