Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zmat3O54836 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zmat3O54836 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zmat3O54836 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zmat3O54836 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zmat3O54836 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zmat3O54836 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zmat3O54836 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zmat3O54836 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zmat3O54836 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zmat3O54836 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zmat3O54836 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zmat3O54836 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zmat3O54836 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zmat3O54836 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zmat3O54836 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zmat3O54836 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zmat3O54836 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zmat3O54836 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zmat3O54836 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zmat3O54836 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zmat3O54836 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Zmat3O54836 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zmat3O54836 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zmat3O54836 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zmat3O54836 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zmat3O54836 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zmat3O54836 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zmat3O54836 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zmat3O54836 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zmat3O54836 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zmat3O54836 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zmat3O54836 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zmat3O54836 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zmat3O54836 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zmat3O54836 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zmat3O54836 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zmat3O54836 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zmat3O54836 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zmat3O54836 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zmat3O54836 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zmat3O54836 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zmat3O54836 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zmat3O54836 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zmat3O54836 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zmat3O54836 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zmat3O54836 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zmat3O54836 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms