Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cavin1O54724 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cavin1O54724 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cavin1O54724 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cavin1O54724 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cavin1O54724 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cavin1O54724 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cavin1O54724 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cavin1O54724 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cavin1O54724 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cavin1O54724 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cavin1O54724 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cavin1O54724 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cavin1O54724 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cavin1O54724 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cavin1O54724 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cavin1O54724 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cavin1O54724 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cavin1O54724 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cavin1O54724 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cavin1O54724 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cavin1O54724 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cavin1O54724 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cavin1O54724 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cavin1O54724 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cavin1O54724 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cavin1O54724 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cavin1O54724 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cavin1O54724 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cavin1O54724 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cavin1O54724 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cavin1O54724 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cavin1O54724 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cavin1O54724 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cavin1O54724 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cavin1O54724 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cavin1O54724 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cavin1O54724 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cavin1O54724 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cavin1O54724 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cavin1O54724 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cavin1O54724 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cavin1O54724 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cavin1O54724 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cavin1O54724 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cavin1O54724 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cavin1O54724 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cavin1O54724 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cavin1O54724 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cavin1O54724 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cavin1O54724 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cavin1O54724 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cavin1O54724 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cavin1O54724 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cavin1O54724 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cavin1O54724 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cavin1O54724 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cavin1O54724 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cavin1O54724 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cavin1O54724 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cavin1O54724 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cavin1O54724 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cavin1O54724 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cavin1O54724 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cavin1O54724 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cavin1O54724 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cavin1O54724 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cavin1O54724 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cavin1O54724 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cavin1O54724 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cavin1O54724 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cavin1O54724 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cavin1O54724 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cavin1O54724 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cavin1O54724 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cavin1O54724 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cavin1O54724 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cavin1O54724 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cavin1O54724 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cavin1O54724 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cavin1O54724 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cavin1O54724 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cavin1O54724 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cavin1O54724 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cavin1O54724 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cavin1O54724 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cavin1O54724 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cavin1O54724 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cavin1O54724 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cavin1O54724 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cavin1O54724 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cavin1O54724 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cavin1O54724 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cavin1O54724 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cavin1O54724 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cavin1O54724 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cavin1O54724 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cavin1O54724 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cavin1O54724 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cavin1O54724 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms