Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Emp3O35912 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Emp3O35912 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Emp3O35912 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Emp3O35912 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Emp3O35912 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Emp3O35912 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Emp3O35912 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Emp3O35912 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Emp3O35912 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Emp3O35912 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Emp3O35912 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Emp3O35912 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Emp3O35912 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Emp3O35912 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Emp3O35912 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Emp3O35912 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Emp3O35912 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Emp3O35912 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Emp3O35912 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Emp3O35912 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Emp3O35912 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Emp3O35912 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Emp3O35912 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Emp3O35912 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Emp3O35912 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Emp3O35912 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Emp3O35912 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Emp3O35912 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Emp3O35912 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Emp3O35912 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Emp3O35912 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Emp3O35912 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Emp3O35912 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Emp3O35912 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Emp3O35912 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Emp3O35912 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Emp3O35912 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Emp3O35912 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Emp3O35912 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Emp3O35912 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Emp3O35912 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Emp3O35912 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Emp3O35912 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Emp3O35912 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Emp3O35912 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Emp3O35912 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Emp3O35912 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Emp3O35912 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Emp3O35912 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Emp3O35912 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Emp3O35912 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Emp3O35912 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Emp3O35912 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Emp3O35912 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Emp3O35912 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Emp3O35912 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Emp3O35912 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Emp3O35912 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Emp3O35912 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Emp3O35912 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Emp3O35912 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Emp3O35912 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Emp3O35912 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Emp3O35912 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Emp3O35912 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Emp3O35912 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Emp3O35912 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Emp3O35912 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Emp3O35912 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Emp3O35912 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Emp3O35912 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Emp3O35912 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Emp3O35912 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Emp3O35912 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Emp3O35912 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Emp3O35912 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Emp3O35912 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Emp3O35912 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Emp3O35912 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Emp3O35912 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Emp3O35912 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Emp3O35912 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Emp3O35912 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Emp3O35912 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Emp3O35912 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms