Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl25O35903 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl25O35903 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl25O35903 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl25O35903 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl25O35903 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl25O35903 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl25O35903 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl25O35903 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl25O35903 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl25O35903 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl25O35903 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl25O35903 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl25O35903 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl25O35903 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl25O35903 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl25O35903 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl25O35903 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl25O35903 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl25O35903 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl25O35903 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl25O35903 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl25O35903 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl25O35903 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl25O35903 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl25O35903 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl25O35903 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccl25O35903 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl25O35903 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl25O35903 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl25O35903 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl25O35903 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl25O35903 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl25O35903 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl25O35903 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl25O35903 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl25O35903 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccl25O35903 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl25O35903 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl25O35903 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms