Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dsg3O35902 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dsg3O35902 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Dsg3O35902 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dsg3O35902 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dsg3O35902 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dsg3O35902 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dsg3O35902 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Dsg3O35902 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Dsg3O35902 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Dsg3O35902 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dsg3O35902 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dsg3O35902 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dsg3O35902 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dsg3O35902 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dsg3O35902 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dsg3O35902 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dsg3O35902 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dsg3O35902 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dsg3O35902 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dsg3O35902 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Dsg3O35902 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dsg3O35902 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dsg3O35902 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dsg3O35902 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dsg3O35902 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dsg3O35902 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Dsg3O35902 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Dsg3O35902 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dsg3O35902 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dsg3O35902 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dsg3O35902 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dsg3O35902 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dsg3O35902 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Dsg3O35902 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dsg3O35902 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dsg3O35902 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dsg3O35902 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dsg3O35902 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Dsg3O35902 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dsg3O35902 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dsg3O35902 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dsg3O35902 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dsg3O35902 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dsg3O35902 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Dsg3O35902 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dsg3O35902 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dsg3O35902 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dsg3O35902 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dsg3O35902 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dsg3O35902 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dsg3O35902 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Dsg3O35902 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dsg3O35902 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Dsg3O35902 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dsg3O35902 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dsg3O35902 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dsg3O35902 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dsg3O35902 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dsg3O35902 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dsg3O35902 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dsg3O35902 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dsg3O35902 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dsg3O35902 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dsg3O35902 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dsg3O35902 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dsg3O35902 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dsg3O35902 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dsg3O35902 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dsg3O35902 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dsg3O35902 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dsg3O35902 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dsg3O35902 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dsg3O35902 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Dsg3O35902 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dsg3O35902 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dsg3O35902 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dsg3O35902 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dsg3O35902 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Dsg3O35902 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dsg3O35902 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dsg3O35902 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dsg3O35902 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dsg3O35902 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dsg3O35902 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dsg3O35902 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dsg3O35902 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Dsg3O35902 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dsg3O35902 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dsg3O35902 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Dsg3O35902 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dsg3O35902 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dsg3O35902 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dsg3O35902 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dsg3O35902 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Dsg3O35902 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Dsg3O35902 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dsg3O35902 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dsg3O35902 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dsg3O35902 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms