Protein–RNA interactions for Protein: O35701

Matn3, Matrilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn3O35701 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Matn3O35701 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Matn3O35701 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Matn3O35701 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Matn3O35701 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Matn3O35701 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Matn3O35701 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Matn3O35701 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Matn3O35701 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Matn3O35701 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Matn3O35701 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Matn3O35701 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Matn3O35701 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Matn3O35701 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Matn3O35701 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Matn3O35701 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Matn3O35701 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Matn3O35701 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matn3O35701 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matn3O35701 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Matn3O35701 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matn3O35701 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Matn3O35701 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Matn3O35701 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Matn3O35701 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Matn3O35701 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Matn3O35701 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matn3O35701 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Matn3O35701 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matn3O35701 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Matn3O35701 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Matn3O35701 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Matn3O35701 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Matn3O35701 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Matn3O35701 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn3O35701 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn3O35701 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matn3O35701 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matn3O35701 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matn3O35701 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matn3O35701 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matn3O35701 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Matn3O35701 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Matn3O35701 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Matn3O35701 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Matn3O35701 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Matn3O35701 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matn3O35701 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matn3O35701 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matn3O35701 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matn3O35701 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matn3O35701 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matn3O35701 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Matn3O35701 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Matn3O35701 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Matn3O35701 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Matn3O35701 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matn3O35701 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matn3O35701 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matn3O35701 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Matn3O35701 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Matn3O35701 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Matn3O35701 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Matn3O35701 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Matn3O35701 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Matn3O35701 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Matn3O35701 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Matn3O35701 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Matn3O35701 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Matn3O35701 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Matn3O35701 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Matn3O35701 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Matn3O35701 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Matn3O35701 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Matn3O35701 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Matn3O35701 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Matn3O35701 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Matn3O35701 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Matn3O35701 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Matn3O35701 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Matn3O35701 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Matn3O35701 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Matn3O35701 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms