Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NudcO35685 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NudcO35685 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NudcO35685 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NudcO35685 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NudcO35685 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NudcO35685 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NudcO35685 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NudcO35685 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NudcO35685 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
NudcO35685 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NudcO35685 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NudcO35685 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NudcO35685 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NudcO35685 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NudcO35685 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NudcO35685 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NudcO35685 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NudcO35685 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NudcO35685 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NudcO35685 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NudcO35685 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NudcO35685 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NudcO35685 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NudcO35685 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NudcO35685 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NudcO35685 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NudcO35685 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NudcO35685 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NudcO35685 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NudcO35685 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NudcO35685 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NudcO35685 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NudcO35685 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NudcO35685 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NudcO35685 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NudcO35685 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NudcO35685 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NudcO35685 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
NudcO35685 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NudcO35685 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NudcO35685 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NudcO35685 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NudcO35685 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NudcO35685 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NudcO35685 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NudcO35685 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NudcO35685 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NudcO35685 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NudcO35685 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NudcO35685 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NudcO35685 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NudcO35685 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NudcO35685 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NudcO35685 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NudcO35685 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NudcO35685 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
NudcO35685 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NudcO35685 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NudcO35685 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NudcO35685 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NudcO35685 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NudcO35685 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NudcO35685 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NudcO35685 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NudcO35685 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NudcO35685 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NudcO35685 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NudcO35685 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NudcO35685 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NudcO35685 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NudcO35685 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NudcO35685 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NudcO35685 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NudcO35685 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NudcO35685 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NudcO35685 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NudcO35685 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NudcO35685 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NudcO35685 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NudcO35685 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NudcO35685 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NudcO35685 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NudcO35685 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NudcO35685 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NudcO35685 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NudcO35685 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NudcO35685 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NudcO35685 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NudcO35685 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NudcO35685 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NudcO35685 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NudcO35685 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NudcO35685 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NudcO35685 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NudcO35685 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NudcO35685 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NudcO35685 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NudcO35685 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NudcO35685 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms