Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clk4O35493 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clk4O35493 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clk4O35493 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clk4O35493 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clk4O35493 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clk4O35493 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clk4O35493 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clk4O35493 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clk4O35493 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clk4O35493 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clk4O35493 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clk4O35493 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clk4O35493 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clk4O35493 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clk4O35493 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clk4O35493 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clk4O35493 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clk4O35493 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clk4O35493 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clk4O35493 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clk4O35493 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clk4O35493 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clk4O35493 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clk4O35493 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clk4O35493 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clk4O35493 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Clk4O35493 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clk4O35493 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clk4O35493 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clk4O35493 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clk4O35493 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Clk4O35493 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clk4O35493 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clk4O35493 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clk4O35493 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clk4O35493 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clk4O35493 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clk4O35493 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clk4O35493 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Clk4O35493 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clk4O35493 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clk4O35493 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clk4O35493 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clk4O35493 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clk4O35493 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clk4O35493 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clk4O35493 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clk4O35493 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clk4O35493 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clk4O35493 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clk4O35493 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clk4O35493 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clk4O35493 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clk4O35493 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clk4O35493 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clk4O35493 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clk4O35493 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clk4O35493 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clk4O35493 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clk4O35493 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clk4O35493 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clk4O35493 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clk4O35493 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clk4O35493 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clk4O35493 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clk4O35493 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clk4O35493 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Clk4O35493 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clk4O35493 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clk4O35493 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clk4O35493 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clk4O35493 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clk4O35493 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clk4O35493 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clk4O35493 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clk4O35493 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clk4O35493 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clk4O35493 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clk4O35493 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clk4O35493 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clk4O35493 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clk4O35493 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clk4O35493 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms