Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccrl2O35457 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccrl2O35457 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccrl2O35457 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccrl2O35457 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccrl2O35457 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccrl2O35457 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccrl2O35457 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccrl2O35457 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccrl2O35457 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccrl2O35457 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccrl2O35457 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccrl2O35457 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccrl2O35457 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccrl2O35457 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccrl2O35457 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccrl2O35457 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccrl2O35457 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccrl2O35457 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccrl2O35457 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccrl2O35457 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccrl2O35457 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccrl2O35457 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccrl2O35457 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccrl2O35457 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccrl2O35457 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccrl2O35457 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccrl2O35457 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccrl2O35457 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccrl2O35457 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccrl2O35457 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccrl2O35457 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccrl2O35457 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccrl2O35457 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccrl2O35457 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccrl2O35457 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccrl2O35457 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccrl2O35457 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccrl2O35457 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccrl2O35457 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccrl2O35457 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccrl2O35457 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccrl2O35457 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccrl2O35457 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccrl2O35457 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccrl2O35457 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccrl2O35457 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccrl2O35457 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccrl2O35457 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccrl2O35457 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccrl2O35457 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccrl2O35457 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccrl2O35457 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccrl2O35457 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccrl2O35457 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccrl2O35457 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccrl2O35457 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccrl2O35457 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccrl2O35457 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccrl2O35457 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccrl2O35457 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccrl2O35457 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccrl2O35457 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccrl2O35457 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccrl2O35457 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccrl2O35457 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccrl2O35457 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccrl2O35457 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccrl2O35457 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccrl2O35457 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccrl2O35457 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccrl2O35457 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccrl2O35457 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccrl2O35457 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccrl2O35457 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccrl2O35457 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccrl2O35457 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccrl2O35457 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccrl2O35457 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccrl2O35457 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccrl2O35457 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccrl2O35457 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccrl2O35457 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccrl2O35457 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms