Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxd2O35392 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxd2O35392 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxd2O35392 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Foxd2O35392 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Foxd2O35392 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxd2O35392 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxd2O35392 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Foxd2O35392 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Foxd2O35392 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Foxd2O35392 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Foxd2O35392 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Foxd2O35392 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Foxd2O35392 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd2O35392 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxd2O35392 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd2O35392 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd2O35392 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxd2O35392 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Foxd2O35392 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Foxd2O35392 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Foxd2O35392 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Foxd2O35392 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxd2O35392 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd2O35392 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd2O35392 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd2O35392 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxd2O35392 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Foxd2O35392 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Foxd2O35392 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Foxd2O35392 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxd2O35392 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Foxd2O35392 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxd2O35392 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Foxd2O35392 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxd2O35392 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Foxd2O35392 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxd2O35392 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxd2O35392 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxd2O35392 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxd2O35392 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxd2O35392 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Foxd2O35392 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxd2O35392 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxd2O35392 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxd2O35392 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxd2O35392 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxd2O35392 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxd2O35392 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxd2O35392 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxd2O35392 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxd2O35392 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxd2O35392 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxd2O35392 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxd2O35392 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxd2O35392 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxd2O35392 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxd2O35392 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxd2O35392 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxd2O35392 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxd2O35392 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxd2O35392 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxd2O35392 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxd2O35392 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxd2O35392 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxd2O35392 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxd2O35392 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Foxd2O35392 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Foxd2O35392 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Foxd2O35392 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Foxd2O35392 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxd2O35392 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxd2O35392 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxd2O35392 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxd2O35392 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxd2O35392 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxd2O35392 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxd2O35392 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxd2O35392 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxd2O35392 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxd2O35392 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxd2O35392 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxd2O35392 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxd2O35392 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxd2O35392 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxd2O35392 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms