Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ClockO08785 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ClockO08785 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ClockO08785 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ClockO08785 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ClockO08785 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ClockO08785 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ClockO08785 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ClockO08785 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ClockO08785 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClockO08785 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClockO08785 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClockO08785 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ClockO08785 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ClockO08785 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ClockO08785 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClockO08785 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClockO08785 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClockO08785 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClockO08785 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClockO08785 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClockO08785 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClockO08785 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClockO08785 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClockO08785 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClockO08785 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClockO08785 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClockO08785 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClockO08785 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClockO08785 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClockO08785 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ClockO08785 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClockO08785 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClockO08785 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClockO08785 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClockO08785 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClockO08785 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ClockO08785 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClockO08785 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClockO08785 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClockO08785 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClockO08785 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClockO08785 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClockO08785 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ClockO08785 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ClockO08785 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ClockO08785 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ClockO08785 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ClockO08785 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClockO08785 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClockO08785 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClockO08785 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClockO08785 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClockO08785 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClockO08785 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClockO08785 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClockO08785 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClockO08785 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClockO08785 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClockO08785 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClockO08785 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClockO08785 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClockO08785 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClockO08785 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClockO08785 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClockO08785 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClockO08785 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClockO08785 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClockO08785 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClockO08785 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClockO08785 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClockO08785 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClockO08785 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClockO08785 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClockO08785 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClockO08785 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClockO08785 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClockO08785 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClockO08785 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ClockO08785 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ClockO08785 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClockO08785 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClockO08785 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClockO08785 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClockO08785 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClockO08785 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClockO08785 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClockO08785 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClockO08785 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClockO08785 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClockO08785 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClockO08785 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClockO08785 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClockO08785 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClockO08785 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ClockO08785 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClockO08785 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClockO08785 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClockO08785 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClockO08785 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms