Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Capn2O08529 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Capn2O08529 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Capn2O08529 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Capn2O08529 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Capn2O08529 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Capn2O08529 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Capn2O08529 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Capn2O08529 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Capn2O08529 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Capn2O08529 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Capn2O08529 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Capn2O08529 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Capn2O08529 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Capn2O08529 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Capn2O08529 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Capn2O08529 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Capn2O08529 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Capn2O08529 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Capn2O08529 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Capn2O08529 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Capn2O08529 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Capn2O08529 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Capn2O08529 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Capn2O08529 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Capn2O08529 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Capn2O08529 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Capn2O08529 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Capn2O08529 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Capn2O08529 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Capn2O08529 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Capn2O08529 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Capn2O08529 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Capn2O08529 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Capn2O08529 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Capn2O08529 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Capn2O08529 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Capn2O08529 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Capn2O08529 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Capn2O08529 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Capn2O08529 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Capn2O08529 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Capn2O08529 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Capn2O08529 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Capn2O08529 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Capn2O08529 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Capn2O08529 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Capn2O08529 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Capn2O08529 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Capn2O08529 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Capn2O08529 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Capn2O08529 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Capn2O08529 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Capn2O08529 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Capn2O08529 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Capn2O08529 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Capn2O08529 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Capn2O08529 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Capn2O08529 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Capn2O08529 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Capn2O08529 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Capn2O08529 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Capn2O08529 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Capn2O08529 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Capn2O08529 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Capn2O08529 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Capn2O08529 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Capn2O08529 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Capn2O08529 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Capn2O08529 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Capn2O08529 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Capn2O08529 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Capn2O08529 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Capn2O08529 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Capn2O08529 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Capn2O08529 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Capn2O08529 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Capn2O08529 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Capn2O08529 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Capn2O08529 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Capn2O08529 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Capn2O08529 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Capn2O08529 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Capn2O08529 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Capn2O08529 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Capn2O08529 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Capn2O08529 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Capn2O08529 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Capn2O08529 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Capn2O08529 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Capn2O08529 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Capn2O08529 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Capn2O08529 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Capn2O08529 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Capn2O08529 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Capn2O08529 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Capn2O08529 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Capn2O08529 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Capn2O08529 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Capn2O08529 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms