Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
1700122O11RikJ3QPW6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700122O11RikJ3QPW6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700122O11RikJ3QPW6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700122O11RikJ3QPW6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700122O11RikJ3QPW6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
1700122O11RikJ3QPW6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
1700122O11RikJ3QPW6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700122O11RikJ3QPW6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700122O11RikJ3QPW6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700122O11RikJ3QPW6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700122O11RikJ3QPW6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700122O11RikJ3QPW6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700122O11RikJ3QPW6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700122O11RikJ3QPW6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700122O11RikJ3QPW6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700122O11RikJ3QPW6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700122O11RikJ3QPW6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700122O11RikJ3QPW6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700122O11RikJ3QPW6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700122O11RikJ3QPW6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700122O11RikJ3QPW6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700122O11RikJ3QPW6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
1700122O11RikJ3QPW6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700122O11RikJ3QPW6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700122O11RikJ3QPW6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700122O11RikJ3QPW6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700122O11RikJ3QPW6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700122O11RikJ3QPW6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700122O11RikJ3QPW6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700122O11RikJ3QPW6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700122O11RikJ3QPW6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700122O11RikJ3QPW6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700122O11RikJ3QPW6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700122O11RikJ3QPW6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700122O11RikJ3QPW6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700122O11RikJ3QPW6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
1700122O11RikJ3QPW6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700122O11RikJ3QPW6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700122O11RikJ3QPW6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
1700122O11RikJ3QPW6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
1700122O11RikJ3QPW6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700122O11RikJ3QPW6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700122O11RikJ3QPW6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700122O11RikJ3QPW6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700122O11RikJ3QPW6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700122O11RikJ3QPW6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700122O11RikJ3QPW6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700122O11RikJ3QPW6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700122O11RikJ3QPW6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700122O11RikJ3QPW6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700122O11RikJ3QPW6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700122O11RikJ3QPW6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
1700122O11RikJ3QPW6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
1700122O11RikJ3QPW6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700122O11RikJ3QPW6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700122O11RikJ3QPW6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700122O11RikJ3QPW6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700122O11RikJ3QPW6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700122O11RikJ3QPW6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700122O11RikJ3QPW6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700122O11RikJ3QPW6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700122O11RikJ3QPW6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms