Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI8

Gm6803, Predicted gene 6803, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6803J3QPI8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6803J3QPI8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6803J3QPI8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm6803J3QPI8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm6803J3QPI8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm6803J3QPI8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm6803J3QPI8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm6803J3QPI8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm6803J3QPI8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6803J3QPI8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6803J3QPI8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm6803J3QPI8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6803J3QPI8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6803J3QPI8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6803J3QPI8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6803J3QPI8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6803J3QPI8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6803J3QPI8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6803J3QPI8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6803J3QPI8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6803J3QPI8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6803J3QPI8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6803J3QPI8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6803J3QPI8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6803J3QPI8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6803J3QPI8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6803J3QPI8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6803J3QPI8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6803J3QPI8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6803J3QPI8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6803J3QPI8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6803J3QPI8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6803J3QPI8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6803J3QPI8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6803J3QPI8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6803J3QPI8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6803J3QPI8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6803J3QPI8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6803J3QPI8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6803J3QPI8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6803J3QPI8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6803J3QPI8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6803J3QPI8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6803J3QPI8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6803J3QPI8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6803J3QPI8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6803J3QPI8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6803J3QPI8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6803J3QPI8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6803J3QPI8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6803J3QPI8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6803J3QPI8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6803J3QPI8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6803J3QPI8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6803J3QPI8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6803J3QPI8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6803J3QPI8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6803J3QPI8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6803J3QPI8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6803J3QPI8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6803J3QPI8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6803J3QPI8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6803J3QPI8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6803J3QPI8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6803J3QPI8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6803J3QPI8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6803J3QPI8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms