Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3099J3QPA5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3099J3QPA5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3099J3QPA5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3099J3QPA5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3099J3QPA5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3099J3QPA5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3099J3QPA5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3099J3QPA5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3099J3QPA5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3099J3QPA5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3099J3QPA5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3099J3QPA5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3099J3QPA5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3099J3QPA5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3099J3QPA5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3099J3QPA5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3099J3QPA5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3099J3QPA5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3099J3QPA5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3099J3QPA5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3099J3QPA5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3099J3QPA5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3099J3QPA5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3099J3QPA5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3099J3QPA5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3099J3QPA5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3099J3QPA5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms