Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim18J3QNP2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim18J3QNP2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim18J3QNP2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim18J3QNP2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim18J3QNP2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim18J3QNP2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim18J3QNP2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim18J3QNP2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim18J3QNP2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim18J3QNP2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim18J3QNP2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim18J3QNP2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim18J3QNP2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim18J3QNP2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim18J3QNP2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim18J3QNP2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim18J3QNP2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim18J3QNP2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim18J3QNP2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim18J3QNP2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smim18J3QNP2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smim18J3QNP2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim18J3QNP2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smim18J3QNP2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smim18J3QNP2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smim18J3QNP2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smim18J3QNP2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smim18J3QNP2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim18J3QNP2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smim18J3QNP2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim18J3QNP2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smim18J3QNP2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim18J3QNP2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smim18J3QNP2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim18J3QNP2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim18J3QNP2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim18J3QNP2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim18J3QNP2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim18J3QNP2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim18J3QNP2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim18J3QNP2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim18J3QNP2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim18J3QNP2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim18J3QNP2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim18J3QNP2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smim18J3QNP2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smim18J3QNP2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim18J3QNP2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim18J3QNP2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim18J3QNP2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim18J3QNP2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim18J3QNP2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim18J3QNP2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim18J3QNP2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim18J3QNP2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim18J3QNP2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Smim18J3QNP2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smim18J3QNP2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim18J3QNP2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim18J3QNP2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim18J3QNP2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim18J3QNP2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim18J3QNP2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim18J3QNP2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim18J3QNP2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim18J3QNP2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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