Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20918J3QN17 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20918J3QN17 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20918J3QN17 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20918J3QN17 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20918J3QN17 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20918J3QN17 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20918J3QN17 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20918J3QN17 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20918J3QN17 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20918J3QN17 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20918J3QN17 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20918J3QN17 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm20918J3QN17 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20918J3QN17 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20918J3QN17 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20918J3QN17 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20918J3QN17 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20918J3QN17 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20918J3QN17 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20918J3QN17 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20918J3QN17 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20918J3QN17 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20918J3QN17 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20918J3QN17 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20918J3QN17 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20918J3QN17 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20918J3QN17 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20918J3QN17 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20918J3QN17 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20918J3QN17 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20918J3QN17 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20918J3QN17 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20918J3QN17 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20918J3QN17 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20918J3QN17 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20918J3QN17 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20918J3QN17 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20918J3QN17 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms