Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp616J3QN14 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp616J3QN14 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp616J3QN14 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp616J3QN14 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp616J3QN14 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp616J3QN14 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp616J3QN14 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp616J3QN14 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp616J3QN14 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp616J3QN14 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp616J3QN14 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp616J3QN14 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp616J3QN14 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp616J3QN14 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp616J3QN14 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp616J3QN14 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp616J3QN14 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp616J3QN14 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp616J3QN14 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp616J3QN14 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp616J3QN14 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp616J3QN14 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp616J3QN14 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp616J3QN14 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp616J3QN14 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp616J3QN14 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp616J3QN14 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp616J3QN14 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp616J3QN14 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp616J3QN14 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp616J3QN14 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp616J3QN14 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp616J3QN14 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp616J3QN14 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp616J3QN14 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp616J3QN14 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp616J3QN14 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp616J3QN14 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp616J3QN14 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp616J3QN14 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp616J3QN14 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp616J3QN14 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zfp616J3QN14 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp616J3QN14 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp616J3QN14 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp616J3QN14 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp616J3QN14 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp616J3QN14 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp616J3QN14 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp616J3QN14 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp616J3QN14 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp616J3QN14 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp616J3QN14 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp616J3QN14 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp616J3QN14 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp616J3QN14 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp616J3QN14 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp616J3QN14 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp616J3QN14 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp616J3QN14 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp616J3QN14 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp616J3QN14 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp616J3QN14 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp616J3QN14 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms