Protein–RNA interactions for Protein: J3QMH4

Gm21866, Predicted gene, 21866, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21866J3QMH4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm21866J3QMH4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21866J3QMH4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm21866J3QMH4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21866J3QMH4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21866J3QMH4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21866J3QMH4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21866J3QMH4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21866J3QMH4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21866J3QMH4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21866J3QMH4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21866J3QMH4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21866J3QMH4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21866J3QMH4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21866J3QMH4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21866J3QMH4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21866J3QMH4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21866J3QMH4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21866J3QMH4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21866J3QMH4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21866J3QMH4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21866J3QMH4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21866J3QMH4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm21866J3QMH4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21866J3QMH4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21866J3QMH4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21866J3QMH4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21866J3QMH4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21866J3QMH4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21866J3QMH4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21866J3QMH4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21866J3QMH4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21866J3QMH4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21866J3QMH4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21866J3QMH4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21866J3QMH4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21866J3QMH4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21866J3QMH4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21866J3QMH4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21866J3QMH4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21866J3QMH4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21866J3QMH4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21866J3QMH4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21866J3QMH4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21866J3QMH4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21866J3QMH4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21866J3QMH4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21866J3QMH4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21866J3QMH4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21866J3QMH4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21866J3QMH4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21866J3QMH4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21866J3QMH4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21866J3QMH4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21866J3QMH4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21866J3QMH4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms