Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgxb3G3X9M3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgxb3G3X9M3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgxb3G3X9M3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgxb3G3X9M3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgxb3G3X9M3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgxb3G3X9M3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgxb3G3X9M3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hmgxb3G3X9M3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgxb3G3X9M3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgxb3G3X9M3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgxb3G3X9M3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgxb3G3X9M3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgxb3G3X9M3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgxb3G3X9M3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgxb3G3X9M3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgxb3G3X9M3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgxb3G3X9M3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgxb3G3X9M3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgxb3G3X9M3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgxb3G3X9M3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgxb3G3X9M3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmgxb3G3X9M3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgxb3G3X9M3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgxb3G3X9M3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgxb3G3X9M3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgxb3G3X9M3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgxb3G3X9M3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgxb3G3X9M3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgxb3G3X9M3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgxb3G3X9M3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgxb3G3X9M3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmgxb3G3X9M3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgxb3G3X9M3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgxb3G3X9M3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgxb3G3X9M3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgxb3G3X9M3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgxb3G3X9M3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgxb3G3X9M3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmgxb3G3X9M3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgxb3G3X9M3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgxb3G3X9M3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmgxb3G3X9M3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmgxb3G3X9M3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmgxb3G3X9M3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmgxb3G3X9M3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmgxb3G3X9M3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgxb3G3X9M3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmgxb3G3X9M3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmgxb3G3X9M3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmgxb3G3X9M3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmgxb3G3X9M3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmgxb3G3X9M3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmgxb3G3X9M3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hmgxb3G3X9M3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hmgxb3G3X9M3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmgxb3G3X9M3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmgxb3G3X9M3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmgxb3G3X9M3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmgxb3G3X9M3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgxb3G3X9M3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmgxb3G3X9M3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmgxb3G3X9M3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmgxb3G3X9M3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmgxb3G3X9M3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmgxb3G3X9M3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmgxb3G3X9M3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmgxb3G3X9M3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmgxb3G3X9M3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmgxb3G3X9M3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms