Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20517G3UVU6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20517G3UVU6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20517G3UVU6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20517G3UVU6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20517G3UVU6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20517G3UVU6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20517G3UVU6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20517G3UVU6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20517G3UVU6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20517G3UVU6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20517G3UVU6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20517G3UVU6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20517G3UVU6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20517G3UVU6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20517G3UVU6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20517G3UVU6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20517G3UVU6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms