Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ88

Gm5145, Predicted pseudogene 5145, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5145F8VQ88 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5145F8VQ88 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5145F8VQ88 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5145F8VQ88 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5145F8VQ88 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5145F8VQ88 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5145F8VQ88 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5145F8VQ88 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5145F8VQ88 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5145F8VQ88 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5145F8VQ88 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm5145F8VQ88 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm5145F8VQ88 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5145F8VQ88 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5145F8VQ88 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5145F8VQ88 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5145F8VQ88 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5145F8VQ88 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5145F8VQ88 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5145F8VQ88 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5145F8VQ88 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5145F8VQ88 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5145F8VQ88 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5145F8VQ88 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5145F8VQ88 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5145F8VQ88 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5145F8VQ88 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5145F8VQ88 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5145F8VQ88 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5145F8VQ88 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5145F8VQ88 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5145F8VQ88 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5145F8VQ88 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5145F8VQ88 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5145F8VQ88 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5145F8VQ88 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5145F8VQ88 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5145F8VQ88 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5145F8VQ88 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5145F8VQ88 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5145F8VQ88 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm5145F8VQ88 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5145F8VQ88 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5145F8VQ88 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5145F8VQ88 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5145F8VQ88 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5145F8VQ88 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5145F8VQ88 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5145F8VQ88 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5145F8VQ88 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5145F8VQ88 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5145F8VQ88 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5145F8VQ88 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5145F8VQ88 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5145F8VQ88 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5145F8VQ88 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5145F8VQ88 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5145F8VQ88 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5145F8VQ88 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5145F8VQ88 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5145F8VQ88 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5145F8VQ88 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5145F8VQ88 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5145F8VQ88 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5145F8VQ88 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5145F8VQ88 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5145F8VQ88 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5145F8VQ88 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5145F8VQ88 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5145F8VQ88 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5145F8VQ88 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5145F8VQ88 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5145F8VQ88 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5145F8VQ88 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5145F8VQ88 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5145F8VQ88 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5145F8VQ88 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5145F8VQ88 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5145F8VQ88 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5145F8VQ88 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5145F8VQ88 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5145F8VQ88 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5145F8VQ88 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5145F8VQ88 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5145F8VQ88 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5145F8VQ88 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms