Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
5830473C10RikF8VQ07 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
5830473C10RikF8VQ07 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
5830473C10RikF8VQ07 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
5830473C10RikF8VQ07 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
5830473C10RikF8VQ07 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
5830473C10RikF8VQ07 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
5830473C10RikF8VQ07 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
5830473C10RikF8VQ07 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
5830473C10RikF8VQ07 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
5830473C10RikF8VQ07 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
5830473C10RikF8VQ07 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
5830473C10RikF8VQ07 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
5830473C10RikF8VQ07 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
5830473C10RikF8VQ07 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
5830473C10RikF8VQ07 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
5830473C10RikF8VQ07 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
5830473C10RikF8VQ07 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
5830473C10RikF8VQ07 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
5830473C10RikF8VQ07 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
5830473C10RikF8VQ07 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
5830473C10RikF8VQ07 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
5830473C10RikF8VQ07 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
5830473C10RikF8VQ07 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
5830473C10RikF8VQ07 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
5830473C10RikF8VQ07 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
5830473C10RikF8VQ07 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
5830473C10RikF8VQ07 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
5830473C10RikF8VQ07 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
5830473C10RikF8VQ07 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
5830473C10RikF8VQ07 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
5830473C10RikF8VQ07 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
5830473C10RikF8VQ07 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
5830473C10RikF8VQ07 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
5830473C10RikF8VQ07 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
5830473C10RikF8VQ07 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
5830473C10RikF8VQ07 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
5830473C10RikF8VQ07 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
5830473C10RikF8VQ07 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
5830473C10RikF8VQ07 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
5830473C10RikF8VQ07 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
5830473C10RikF8VQ07 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
5830473C10RikF8VQ07 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
5830473C10RikF8VQ07 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
5830473C10RikF8VQ07 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
5830473C10RikF8VQ07 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
5830473C10RikF8VQ07 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
5830473C10RikF8VQ07 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
5830473C10RikF8VQ07 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
5830473C10RikF8VQ07 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
5830473C10RikF8VQ07 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
5830473C10RikF8VQ07 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
5830473C10RikF8VQ07 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
5830473C10RikF8VQ07 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
5830473C10RikF8VQ07 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
5830473C10RikF8VQ07 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
5830473C10RikF8VQ07 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
5830473C10RikF8VQ07 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
5830473C10RikF8VQ07 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
5830473C10RikF8VQ07 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
5830473C10RikF8VQ07 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
5830473C10RikF8VQ07 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
5830473C10RikF8VQ07 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
5830473C10RikF8VQ07 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
5830473C10RikF8VQ07 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
5830473C10RikF8VQ07 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
5830473C10RikF8VQ07 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
5830473C10RikF8VQ07 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
5830473C10RikF8VQ07 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
5830473C10RikF8VQ07 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
5830473C10RikF8VQ07 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
5830473C10RikF8VQ07 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
5830473C10RikF8VQ07 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
5830473C10RikF8VQ07 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
5830473C10RikF8VQ07 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
5830473C10RikF8VQ07 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
5830473C10RikF8VQ07 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
5830473C10RikF8VQ07 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
5830473C10RikF8VQ07 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
5830473C10RikF8VQ07 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
5830473C10RikF8VQ07 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
5830473C10RikF8VQ07 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
5830473C10RikF8VQ07 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
5830473C10RikF8VQ07 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
5830473C10RikF8VQ07 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
5830473C10RikF8VQ07 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
5830473C10RikF8VQ07 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
5830473C10RikF8VQ07 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
5830473C10RikF8VQ07 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
5830473C10RikF8VQ07 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
5830473C10RikF8VQ07 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
5830473C10RikF8VQ07 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
5830473C10RikF8VQ07 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
5830473C10RikF8VQ07 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
5830473C10RikF8VQ07 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
5830473C10RikF8VQ07 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
5830473C10RikF8VQ07 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
5830473C10RikF8VQ07 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
5830473C10RikF8VQ07 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms