Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcdh9F8VPK8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcdh9F8VPK8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcdh9F8VPK8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcdh9F8VPK8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcdh9F8VPK8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcdh9F8VPK8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcdh9F8VPK8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcdh9F8VPK8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcdh9F8VPK8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcdh9F8VPK8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcdh9F8VPK8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcdh9F8VPK8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcdh9F8VPK8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcdh9F8VPK8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcdh9F8VPK8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcdh9F8VPK8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcdh9F8VPK8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcdh9F8VPK8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcdh9F8VPK8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcdh9F8VPK8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcdh9F8VPK8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcdh9F8VPK8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdh9F8VPK8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdh9F8VPK8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcdh9F8VPK8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcdh9F8VPK8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdh9F8VPK8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdh9F8VPK8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdh9F8VPK8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcdh9F8VPK8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcdh9F8VPK8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcdh9F8VPK8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcdh9F8VPK8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcdh9F8VPK8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcdh9F8VPK8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcdh9F8VPK8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pcdh9F8VPK8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdh9F8VPK8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdh9F8VPK8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdh9F8VPK8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcdh9F8VPK8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcdh9F8VPK8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcdh9F8VPK8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcdh9F8VPK8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcdh9F8VPK8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcdh9F8VPK8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcdh9F8VPK8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcdh9F8VPK8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdh9F8VPK8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdh9F8VPK8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdh9F8VPK8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdh9F8VPK8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdh9F8VPK8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdh9F8VPK8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdh9F8VPK8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdh9F8VPK8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcdh9F8VPK8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pcdh9F8VPK8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdh9F8VPK8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdh9F8VPK8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdh9F8VPK8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdh9F8VPK8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdh9F8VPK8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdh9F8VPK8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdh9F8VPK8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdh9F8VPK8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdh9F8VPK8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdh9F8VPK8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdh9F8VPK8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdh9F8VPK8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdh9F8VPK8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdh9F8VPK8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdh9F8VPK8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdh9F8VPK8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdh9F8VPK8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdh9F8VPK8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdh9F8VPK8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdh9F8VPK8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdh9F8VPK8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdh9F8VPK8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdh9F8VPK8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdh9F8VPK8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdh9F8VPK8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 317.1 ms