Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm5218F6YH22 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm5218F6YH22 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm5218F6YH22 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm5218F6YH22 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm5218F6YH22 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm5218F6YH22 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm5218F6YH22 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm5218F6YH22 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm5218F6YH22 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm5218F6YH22 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5218F6YH22 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5218F6YH22 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5218F6YH22 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5218F6YH22 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5218F6YH22 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5218F6YH22 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5218F6YH22 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5218F6YH22 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5218F6YH22 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm5218F6YH22 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm5218F6YH22 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm5218F6YH22 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm5218F6YH22 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5218F6YH22 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5218F6YH22 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm5218F6YH22 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm5218F6YH22 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm5218F6YH22 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5218F6YH22 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5218F6YH22 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5218F6YH22 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5218F6YH22 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm5218F6YH22 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm5218F6YH22 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5218F6YH22 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm5218F6YH22 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms