Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm8444F6XS56 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm8444F6XS56 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm8444F6XS56 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm8444F6XS56 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm8444F6XS56 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm8444F6XS56 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm8444F6XS56 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm8444F6XS56 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm8444F6XS56 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm8444F6XS56 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm8444F6XS56 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm8444F6XS56 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm8444F6XS56 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm8444F6XS56 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm8444F6XS56 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm8444F6XS56 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm8444F6XS56 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm8444F6XS56 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm8444F6XS56 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm8444F6XS56 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm8444F6XS56 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm8444F6XS56 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm8444F6XS56 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm8444F6XS56 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm8444F6XS56 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm8444F6XS56 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm8444F6XS56 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm8444F6XS56 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm8444F6XS56 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm8444F6XS56 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm8444F6XS56 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm8444F6XS56 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm8444F6XS56 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm8444F6XS56 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm8444F6XS56 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm8444F6XS56 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm8444F6XS56 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm8444F6XS56 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm8444F6XS56 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm8444F6XS56 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm8444F6XS56 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm8444F6XS56 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm8444F6XS56 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm8444F6XS56 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm8444F6XS56 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm8444F6XS56 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8444F6XS56 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm8444F6XS56 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8444F6XS56 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8444F6XS56 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8444F6XS56 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8444F6XS56 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8444F6XS56 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8444F6XS56 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm8444F6XS56 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8444F6XS56 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm8444F6XS56 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm8444F6XS56 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm8444F6XS56 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm8444F6XS56 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm8444F6XS56 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8444F6XS56 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms