Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
4933403O08RikF6UK53 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933403O08RikF6UK53 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933403O08RikF6UK53 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933403O08RikF6UK53 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933403O08RikF6UK53 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933403O08RikF6UK53 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933403O08RikF6UK53 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933403O08RikF6UK53 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933403O08RikF6UK53 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933403O08RikF6UK53 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933403O08RikF6UK53 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933403O08RikF6UK53 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933403O08RikF6UK53 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933403O08RikF6UK53 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933403O08RikF6UK53 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933403O08RikF6UK53 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4933403O08RikF6UK53 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
4933403O08RikF6UK53 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933403O08RikF6UK53 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933403O08RikF6UK53 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933403O08RikF6UK53 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933403O08RikF6UK53 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933403O08RikF6UK53 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933403O08RikF6UK53 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933403O08RikF6UK53 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933403O08RikF6UK53 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933403O08RikF6UK53 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933403O08RikF6UK53 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933403O08RikF6UK53 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
4933403O08RikF6UK53 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933403O08RikF6UK53 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933403O08RikF6UK53 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933403O08RikF6UK53 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933403O08RikF6UK53 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933403O08RikF6UK53 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
4933403O08RikF6UK53 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933403O08RikF6UK53 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
4933403O08RikF6UK53 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933403O08RikF6UK53 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933403O08RikF6UK53 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933403O08RikF6UK53 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933403O08RikF6UK53 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933403O08RikF6UK53 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933403O08RikF6UK53 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933403O08RikF6UK53 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933403O08RikF6UK53 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933403O08RikF6UK53 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
4933403O08RikF6UK53 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933403O08RikF6UK53 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933403O08RikF6UK53 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933403O08RikF6UK53 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933403O08RikF6UK53 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
4933403O08RikF6UK53 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933403O08RikF6UK53 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
4933403O08RikF6UK53 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933403O08RikF6UK53 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933403O08RikF6UK53 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933403O08RikF6UK53 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933403O08RikF6UK53 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933403O08RikF6UK53 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933403O08RikF6UK53 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
4933403O08RikF6UK53 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933403O08RikF6UK53 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933403O08RikF6UK53 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933403O08RikF6UK53 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933403O08RikF6UK53 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933403O08RikF6UK53 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933403O08RikF6UK53 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933403O08RikF6UK53 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933403O08RikF6UK53 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933403O08RikF6UK53 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933403O08RikF6UK53 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933403O08RikF6UK53 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933403O08RikF6UK53 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933403O08RikF6UK53 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4933403O08RikF6UK53 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933403O08RikF6UK53 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933403O08RikF6UK53 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933403O08RikF6UK53 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933403O08RikF6UK53 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933403O08RikF6UK53 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933403O08RikF6UK53 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933403O08RikF6UK53 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933403O08RikF6UK53 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
4933403O08RikF6UK53 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933403O08RikF6UK53 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933403O08RikF6UK53 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933403O08RikF6UK53 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933403O08RikF6UK53 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933403O08RikF6UK53 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933403O08RikF6UK53 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933403O08RikF6UK53 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933403O08RikF6UK53 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933403O08RikF6UK53 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933403O08RikF6UK53 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933403O08RikF6UK53 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933403O08RikF6UK53 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933403O08RikF6UK53 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933403O08RikF6UK53 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms