Protein–RNA interactions for Protein: F6SVV1

Gm9493, 40S ribosomal protein S7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9493F6SVV1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm9493F6SVV1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm9493F6SVV1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm9493F6SVV1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm9493F6SVV1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm9493F6SVV1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm9493F6SVV1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm9493F6SVV1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm9493F6SVV1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm9493F6SVV1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm9493F6SVV1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm9493F6SVV1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm9493F6SVV1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm9493F6SVV1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm9493F6SVV1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm9493F6SVV1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm9493F6SVV1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm9493F6SVV1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm9493F6SVV1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm9493F6SVV1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm9493F6SVV1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm9493F6SVV1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm9493F6SVV1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm9493F6SVV1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm9493F6SVV1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm9493F6SVV1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm9493F6SVV1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm9493F6SVV1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm9493F6SVV1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm9493F6SVV1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm9493F6SVV1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm9493F6SVV1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm9493F6SVV1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm9493F6SVV1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm9493F6SVV1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm9493F6SVV1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm9493F6SVV1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm9493F6SVV1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm9493F6SVV1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm9493F6SVV1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm9493F6SVV1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm9493F6SVV1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm9493F6SVV1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm9493F6SVV1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm9493F6SVV1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm9493F6SVV1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm9493F6SVV1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm9493F6SVV1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm9493F6SVV1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm9493F6SVV1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm9493F6SVV1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm9493F6SVV1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm9493F6SVV1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm9493F6SVV1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm9493F6SVV1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm9493F6SVV1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm9493F6SVV1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm9493F6SVV1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm9493F6SVV1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm9493F6SVV1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm9493F6SVV1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm9493F6SVV1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm9493F6SVV1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm9493F6SVV1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm9493F6SVV1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm9493F6SVV1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms