Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Syngap1F6SEU4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Syngap1F6SEU4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Syngap1F6SEU4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Syngap1F6SEU4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Syngap1F6SEU4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Syngap1F6SEU4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Syngap1F6SEU4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Syngap1F6SEU4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Syngap1F6SEU4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Syngap1F6SEU4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Syngap1F6SEU4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Syngap1F6SEU4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Syngap1F6SEU4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Syngap1F6SEU4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Syngap1F6SEU4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Syngap1F6SEU4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Syngap1F6SEU4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Syngap1F6SEU4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Syngap1F6SEU4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Syngap1F6SEU4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Syngap1F6SEU4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Syngap1F6SEU4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Syngap1F6SEU4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Syngap1F6SEU4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Syngap1F6SEU4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Syngap1F6SEU4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Syngap1F6SEU4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syngap1F6SEU4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syngap1F6SEU4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syngap1F6SEU4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syngap1F6SEU4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syngap1F6SEU4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Syngap1F6SEU4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Syngap1F6SEU4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Syngap1F6SEU4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Syngap1F6SEU4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Syngap1F6SEU4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Syngap1F6SEU4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Syngap1F6SEU4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Syngap1F6SEU4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Syngap1F6SEU4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Syngap1F6SEU4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Syngap1F6SEU4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Syngap1F6SEU4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Syngap1F6SEU4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Syngap1F6SEU4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Syngap1F6SEU4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Syngap1F6SEU4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Syngap1F6SEU4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Syngap1F6SEU4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Syngap1F6SEU4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Syngap1F6SEU4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Syngap1F6SEU4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Syngap1F6SEU4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Syngap1F6SEU4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Syngap1F6SEU4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Syngap1F6SEU4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Syngap1F6SEU4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Syngap1F6SEU4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Syngap1F6SEU4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Syngap1F6SEU4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Syngap1F6SEU4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Syngap1F6SEU4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Syngap1F6SEU4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Syngap1F6SEU4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Syngap1F6SEU4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Syngap1F6SEU4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Syngap1F6SEU4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Syngap1F6SEU4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Syngap1F6SEU4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Syngap1F6SEU4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Syngap1F6SEU4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Syngap1F6SEU4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Syngap1F6SEU4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Syngap1F6SEU4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Syngap1F6SEU4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Syngap1F6SEU4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Syngap1F6SEU4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Syngap1F6SEU4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Syngap1F6SEU4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Syngap1F6SEU4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Syngap1F6SEU4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Syngap1F6SEU4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Syngap1F6SEU4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Syngap1F6SEU4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Syngap1F6SEU4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Syngap1F6SEU4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Syngap1F6SEU4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Syngap1F6SEU4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Syngap1F6SEU4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Syngap1F6SEU4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Syngap1F6SEU4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Syngap1F6SEU4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Syngap1F6SEU4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Syngap1F6SEU4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Syngap1F6SEU4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Syngap1F6SEU4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Syngap1F6SEU4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Syngap1F6SEU4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms