Protein–RNA interactions for Protein: F6RSK3

Gm17430, Predicted gene, 17430, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17430F6RSK3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17430F6RSK3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17430F6RSK3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17430F6RSK3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17430F6RSK3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17430F6RSK3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17430F6RSK3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17430F6RSK3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17430F6RSK3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17430F6RSK3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17430F6RSK3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17430F6RSK3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17430F6RSK3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17430F6RSK3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm17430F6RSK3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17430F6RSK3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17430F6RSK3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17430F6RSK3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17430F6RSK3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17430F6RSK3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17430F6RSK3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17430F6RSK3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17430F6RSK3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm17430F6RSK3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm17430F6RSK3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17430F6RSK3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17430F6RSK3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm17430F6RSK3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17430F6RSK3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm17430F6RSK3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17430F6RSK3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm17430F6RSK3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17430F6RSK3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17430F6RSK3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17430F6RSK3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm17430F6RSK3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm17430F6RSK3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17430F6RSK3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17430F6RSK3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17430F6RSK3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17430F6RSK3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17430F6RSK3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17430F6RSK3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17430F6RSK3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms