Protein–RNA interactions for Protein: F2Z493

Magea4, Melanoma antigen, family A, 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea4F2Z493 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Magea4F2Z493 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Magea4F2Z493 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Magea4F2Z493 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Magea4F2Z493 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Magea4F2Z493 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Magea4F2Z493 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Magea4F2Z493 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Magea4F2Z493 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Magea4F2Z493 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Magea4F2Z493 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Magea4F2Z493 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Magea4F2Z493 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Magea4F2Z493 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Magea4F2Z493 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Magea4F2Z493 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Magea4F2Z493 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Magea4F2Z493 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Magea4F2Z493 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Magea4F2Z493 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Magea4F2Z493 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Magea4F2Z493 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Magea4F2Z493 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Magea4F2Z493 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Magea4F2Z493 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Magea4F2Z493 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Magea4F2Z493 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Magea4F2Z493 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Magea4F2Z493 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Magea4F2Z493 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Magea4F2Z493 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Magea4F2Z493 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Magea4F2Z493 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Magea4F2Z493 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Magea4F2Z493 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Magea4F2Z493 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Magea4F2Z493 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Magea4F2Z493 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Magea4F2Z493 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Magea4F2Z493 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Magea4F2Z493 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Magea4F2Z493 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Magea4F2Z493 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Magea4F2Z493 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Magea4F2Z493 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Magea4F2Z493 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Magea4F2Z493 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Magea4F2Z493 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Magea4F2Z493 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Magea4F2Z493 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Magea4F2Z493 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Magea4F2Z493 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Magea4F2Z493 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Magea4F2Z493 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Magea4F2Z493 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Magea4F2Z493 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Magea4F2Z493 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Magea4F2Z493 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Magea4F2Z493 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Magea4F2Z493 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Magea4F2Z493 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Magea4F2Z493 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Magea4F2Z493 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Magea4F2Z493 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Magea4F2Z493 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Magea4F2Z493 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Magea4F2Z493 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Magea4F2Z493 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Magea4F2Z493 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Magea4F2Z493 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Magea4F2Z493 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Magea4F2Z493 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Magea4F2Z493 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Magea4F2Z493 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Magea4F2Z493 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Magea4F2Z493 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Magea4F2Z493 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Magea4F2Z493 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Magea4F2Z493 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Magea4F2Z493 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Magea4F2Z493 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Magea4F2Z493 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Magea4F2Z493 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Magea4F2Z493 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Magea4F2Z493 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Magea4F2Z493 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Magea4F2Z493 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Magea4F2Z493 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Magea4F2Z493 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Magea4F2Z493 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Magea4F2Z493 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Magea4F2Z493 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Magea4F2Z493 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Magea4F2Z493 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Magea4F2Z493 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Magea4F2Z493 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Magea4F2Z493 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Magea4F2Z493 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Magea4F2Z493 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Magea4F2Z493 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms