Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa27F2Z403 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa27F2Z403 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa27F2Z403 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa27F2Z403 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa27F2Z403 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa27F2Z403 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa27F2Z403 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa27F2Z403 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa27F2Z403 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa27F2Z403 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa27F2Z403 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa27F2Z403 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa27F2Z403 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa27F2Z403 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa27F2Z403 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa27F2Z403 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa27F2Z403 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa27F2Z403 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa27F2Z403 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa27F2Z403 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa27F2Z403 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa27F2Z403 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa27F2Z403 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa27F2Z403 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa27F2Z403 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms