Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2610001J05RikF2Z3Y9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2610001J05RikF2Z3Y9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
2610001J05RikF2Z3Y9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2610001J05RikF2Z3Y9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2610001J05RikF2Z3Y9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2610001J05RikF2Z3Y9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
2610001J05RikF2Z3Y9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
2610001J05RikF2Z3Y9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms