Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms