Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Defa35E9QLQ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa35E9QLQ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa35E9QLQ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa35E9QLQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa35E9QLQ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa35E9QLQ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa35E9QLQ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms