Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y3

4930546C10Rik, RIKEN cDNA 4930546C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930546C10RikE9Q4Y3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930546C10RikE9Q4Y3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930546C10RikE9Q4Y3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930546C10RikE9Q4Y3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930546C10RikE9Q4Y3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930546C10RikE9Q4Y3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930546C10RikE9Q4Y3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930546C10RikE9Q4Y3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930546C10RikE9Q4Y3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms