Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd4E9Q2E4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hectd4E9Q2E4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hectd4E9Q2E4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hectd4E9Q2E4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hectd4E9Q2E4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hectd4E9Q2E4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hectd4E9Q2E4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hectd4E9Q2E4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hectd4E9Q2E4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hectd4E9Q2E4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hectd4E9Q2E4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hectd4E9Q2E4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hectd4E9Q2E4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hectd4E9Q2E4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hectd4E9Q2E4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hectd4E9Q2E4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd4E9Q2E4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd4E9Q2E4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd4E9Q2E4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd4E9Q2E4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd4E9Q2E4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd4E9Q2E4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd4E9Q2E4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd4E9Q2E4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hectd4E9Q2E4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Hectd4E9Q2E4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hectd4E9Q2E4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms